O naší skupině
Cílem naší skupiny je nalézt nové funkce nekódujících převážně regulačních RNA. Věříme, že chemické RNA modifikace jsou zodpovědné za velkou část různých funkcí RNA. Nicméně, pouze některé z těchto funkcí byly zatím objeveny a to především z důvodů nedostatečně citlivých metod, které má dnešní věda k dispozici. Nedávno byly díky UPLC/MS objeveny dvě nové RNA modifikace CoA a NAD. NAD bylo pomocí tzv. NAD captureSeq detekováno na 5’ konci některých regulačních a mRNA jak u prokaryot tak eukaryot. V našem výzkumu využíváme viry jako ideální modelové systémy pro objev a odhalení funkce RNA modifikací. Viry mají jednoduchou vnitřní strukturu a jsou namnoženy v hostitelské buňce. Soustředíme se na klinicky relevantní viry (např. HIV, Picornaviry a Vaccinia Virus) a na vývoj tzv. vychytávacích technik, které by nám umožnily identifikovat RNA sekvence obsahující různé RNA modifikace. V dalších letech se budeme soustředit na odhalení funkce, biogenese a biodegradace nových RNA modifikací.
